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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
留住光阴守住幸福 摄影家为村民免费拍“全家福”******
(新春走基层)留住光阴守住幸福 摄影家为村民免费拍“全家福”
中新网宁德1月27日电 (褚子强)“来，人往里面侧一点……”春节期间，福建省宁德市蕉城区洋中镇东山古街内热闹异常，来自蕉城区摄影家协会的摄影家们正耐心指导村民调整姿态，拍出好看的“全家福”。
摄影家帮助村民拍照。 褚子强 摄全家福，作为一家人情感的纽带，以及团圆时刻的记忆，记载着一个家庭的幸福与成长。据村民介绍，村中部分老者十几年从来都没有拍摄过像样的“全家福”，一听说有专业摄影师来为他们拍照，便拖家带口来到古街，等着摄影师为他们拍“全家福”。
“其实之前也想拍‘全家福’来着，但是因为不方便就没去了，没想到这次能在家门口体验到专业摄像师给我们带来的服务，心里很开心。”东山村村民陈大伯说。
摄影家帮助村民拍照。 褚子强 摄全家同框，定格的是一个个小家庭团圆幸福的瞬间，一张张幸福的笑脸，也折射出物质生活和精神文化生活水平的不断提高。
“今年是我们第七年进行这个活动了，今天一共拍摄了140多张照片，虽然需要提前准备东西，但是在为村民们拍照时还是很开心，收获满满。”蕉城区摄影家协会工作人员告诉记者，随着生活水平的提高，村民们的精神状态也随之转变；希望通过免费拍摄全家福的活动，为村民们留住光阴、守住幸福，让大家感受到来自镜头一端的温暖。
摄影家们拍摄的好看的“全家福”。 褚子强 摄记者了解到，今年蕉城区摄影家协会还前往了三都镇，为村民进行“全家福”拍摄。
全家福拍摄公益活动是蕉城区摄影家协会近年来举办的一项重要文化惠民活动，目前已连续举办七年。该协会利用春节期间村民回家团圆的时机，组织摄影志愿者深入乡村为百姓送去节日里的特别“礼物”，把民众的新春祝福定格在“全家福”图片中，留住精彩的瞬间，让民众度过一个愉快的新春。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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